高速基因测序仪受到质疑

第7版(科技)
专栏：

　　高速基因测序仪受到质疑
　　笙珂
　　去年5月，一则消息轰动了生物学界：美国人文特尔发明的一种新方法据说可以大大加快基因测序的速度，有公司根据他提供的方法，投巨资制造出新的基因测序仪，用于营利的目的，公益性的人类基因组计划将面临巨大的挑战。本报对此曾作过报道。今年3月19日，英国学者莫里金和麦克莫瑞公布了对这种ABI3700测序仪的检测结果。人们似乎稍稍松了一口气，因为结果表明，这种仪器的有效性值得怀疑。
　　过去的基因测序方法是以电流通过凝胶状物质来分离基因中的DNA片段，技术人员每测一批数据后就要更换一次凝胶的基片，所以速度较慢。ABI3700采用新的毛细管技术，在又长又细的管子里泵入聚合物液体，用层析的方法分离DNA，可以一天24小时不停运转，而且几乎不需人力。
　　然而这种新的测序方法有它的缺点。虽然从表面上看，工作的速度加快了，但它所读取的基因序列的长度也相对变短了。最后实际上它测得相同数据的花销，反而比原来的方法提高一倍。同时，“阅读长度”变短给基因序列的拼接带来了新的难度，用它所测得的基因图谱可能会出现“裂缝”。